Acordul caută să protejeze cele 45 de specii de lilieci identificate pe teritoriul Europei prin măsuri legislative de conservare şi cooperare între state, recunoscând starea nefavorabilă de conservare a liliecilor în Europa şi în state din aria de răspândire aflată în afara Europei şi, în special, pericolul grav care îi ameninţă, rezultat din degradarea habitatului, perturbarea locurilor de adăpost şi din utilizarea anumitor pesticide. Obiectivele Acordului sunt: asigurarea protecţiei speciilor de lilieci aflate pe cale de dispariţie; promovarea cooperării între state în vederea creşterii gradului de protecţie a populaţiilor de lilieci; identificarea rutelor de migraţie şi a posibilelor pericole care ar putea periclita populaţiile de lilieci.